但发动机动力不足和飞行稳定性仍有待提高，加之辅助翼的设计，使得隐形能力降低。而且发动起喷器口露在外面，使得对红外线探测的躲避能力严重降低。
更大缺陷，是歼-20使用的材料使得电波吸收不足20%，这一点与能够吸收80%的F22相比，落后较多。不过，通过电波反射面积来衡量隐形性能的RCS值方面，F22是0.1平米，歼-20达到了0.1-0.5之间。
最核心的发动机动力问题，使得歼-20在实际战斗中的攻防能力受到质疑。外界普遍分析认为，歼-20的巡航速度没有突破超音速应具有的水准，主要症结在于中国没有掌握顶级碳纤维材料生产技术，歼-20机体使用的碳纤维材料比例过低，致使机体过重所致。
据悉，对比F22的16吨推力、音速1.5倍的速度，中国产歼-20的WS10A、或进口的俄罗斯AL31发动机，都最高只有12吨左右推力。虽然俄罗斯有性能更高的117S发动机，但拒绝对华出口，而中国新一代的WS15发动机，可能需要花费10-15年时间进行研制。
同时，由于机体过重，在现代化空战中需要的短距离交战和快速升空方面，歼-20的表现也不甚理想。因此，综合战力方面，虽然被称为第五代战机，但歼-20甚至对美国第四代战机也不具备必胜优势。