mRNA疫苗的工作原理是，它会进入人体细胞，使细胞内部生出刺突蛋白并从细胞表面溢出，从而诱使免疫系统对这种含有刺突蛋白的细胞进行识别和攻击，也就是说，mRNA疫苗是通过牺牲健康的细胞来诱发免疫的。mRNA技术在用于治疗癌症的试验时，就是以这种方式来试图诱导免疫系统对癌细胞进行攻击的。
所以，mRNA疫苗是一种伤害性疫苗，这是与传统疫苗不同的地方。随着血液循环，它可能造成体内各种随机的隐性损伤，而心脏会首当其冲，因为静脉回流首先到达心脏，所以心肌损伤最为普遍。
接种mRNA疫苗，等于给我们的细胞内注入外来物种的遗传信息代码以及包括纳米载体在内的其他"外源物质"， 并在我们的细胞内表达异种生物的蛋白质，这是引发体内各种潜在损伤的原因。被侵犯的细胞不仅限于肌肉组织的细胞，还可能是心肌，肝脏，胰腺等等各器官的细胞，甚至包括神经细胞和免疫细胞。