早在四、五月份，就有不少报道称乌克兰军方和乌克兰政府之间存在严重分歧，军方认为以总统泽连斯基为代表的乌克兰政府干涉正常的军事指挥，让乌军蒙受了许多本可避免的、毫无意义的伤亡；而泽连斯基政府则认为乌克兰军方拒绝服从命令，多次擅自行动，破坏了乌克兰政府的全局部署。不过这些报道均属传闻，未能得到任何证实。但是七月五日，乌克兰总统泽连斯基在一次全国讲话中公开对乌军表达了“失望”，美国媒体《新闻周刊》评价称，这是“极为少见”的。
据乌克兰媒体《基辅独立报》、美国媒体《新闻周刊》等外媒报道，当地时间七月五日，乌克兰总统泽连斯基在一次全国讲话中公开批评乌克兰军队“在没有听取总统意见的情况下做出决定”，引发了“大量不必要的争端”，这让他对军队感到“极为失望”。据悉，乌克兰武装力量总参谋部于当地时间七月五日颁布了新的征兵规定，这份新规定要求，所有乌克兰服兵役人员或其他适合服兵役的人员，只有在本地征兵办公室允许的情况下才可以离开自己的属地。军事专家认为，这是由于乌军在北顿涅茨克-利西昌斯克战役后损失了太多的兵员，因此需要通过这种方式加强人口管控，方便军方尽快募集乃至强行征集到足够的兵员补充部队。
只不过这道命令涉嫌干涉普通民众的日常生活，美国《新闻周刊》解读称，按照乌克兰总参谋部的新版征兵规定以及其他文件的规定，即使一名乌克兰公民并未进入军队服役，只要他是年龄在十八至六十周岁的男性，就会被乌军认为“适合服兵役”，进而受到军方的管制。这项规定的管辖范围显然已经超越了普通军人和预备役人员，也将普通公民纳入了军方的管辖范围，侵吞了政府的权力。因此泽连斯基才会在第一时间就在全国讲话中怒斥军方，指责军方越过总统擅自做出决定，并明确提出对军方“感到失望”。
不过据被俘的乌军士兵供认，乌军将平民强征入伍的现象早已存在，一些西方媒体也证明了这一点，乌克兰政府和泽连斯基也默许了这一行为。但是为何乌克兰军方突然颁布新规，将把平民强征入伍的行为公开化、制度化呢？而乌克兰政府又为何一改此前睁一只眼闭一只眼的态度，对军方展开严厉批评呢？即使乌克兰政府对军方的政策有不满，在大敌当前的情况下也应当与军方低调沟通，而非在公开场合严辞批评军方。有评论家认为，这是因为北顿涅茨克—利西昌斯克战役的失败全面激化了乌军和乌克兰政府之间的矛盾，才让双方以征兵问题为切口，将双方的矛盾全面公开化、透明化。
自2014年顿巴斯冲突以来，乌克兰军方特别是包括亚速营在内的国民卫队就高度军阀化，对乌克兰政府有所不服从。本次俄乌冲突爆发初期，由于俄军大兵压境，一度让乌克兰政府和军方之间的矛盾出现缓解。但是随着俄军取消了对基辅的围攻，乌克兰军队和政府之间的矛盾开始加剧了。双方的第一重矛盾在于泽连斯基更加信任西方的军事顾问，而非乌克兰本土高级将领。据美媒披露，今年五月初英国军事顾问建议泽连斯基对蛇岛发动反击，在五月九日前夺回蛇岛，让俄罗斯在胜利日大阅兵之时出丑。乌克兰总参谋部基于双方实力对比，反对盲目发动反击，但是泽连斯基还是按照英国军事顾问的建议，派出海军陆战队对蛇岛发动攻势。结果这些乌军精锐部队被俄军大量杀伤，付出惨痛伤亡却未取得任何战果。
第二重矛盾在于泽连斯基多次要求乌军坚守死地，拒绝乌军撤退请求。在北顿涅茨克攻防战中，俄军在五月底攻占了红利曼，对北顿涅茨克的乌军形成三面包围之势，并可以对当地乌军的后勤补给线进行火力封锁。从这时开始，北顿涅茨克的守军就多次请求撤退，但是乌克兰政府为了在西方国家面前表演“坚决抵抗”的决心，多次拒绝了乌军的撤退请求，让乌军在极端危险的环境坚守阵地。值得注意的是，虽然乌军于六月底撤离了北顿涅茨克、于七月初放弃了利西昌斯克，但是这些消息都是由俄方或者乌克兰军队发布的，乌克兰政府在这些消息发布之初甚至公开“辟谣”，称这些城市仍在乌军的掌握之中，直到几个小时之后才不情不愿地承认俄军已经完全控制了这些地区。这或许足以证明，乌军是在未经过乌克兰政府批准的情况下擅自撤离的。