10月12日，港英政府發布九龍半島戒嚴令。10月13日，香港警方大肆掃蕩九龍騷亂中的不法份子，總共拘捕3,000餘人。
10月14日，警方與駐港英軍逐步平息騷亂後，大舉搜捕參與暴動的人士，在李鄭屋、大坑東等地拘捕1千多人，並根據1956年10月14日制定《1956年非常時期（拘留）規例》有權無須經過裁判司署審理而拘留疑犯14天，以便偵訊，經港督酌定後可將扣留期間再度延長14天[21]。
最後暴亂在11月14日平息，總共最少造成60人死亡，300人受傷，超過1000人被捕，當中部份人被逮解出境後選擇前往台灣。
後遣駐港英軍駕駛裝甲車進入現場，有關部門又調派踞喀兵接替警察在沙頭角駐守，香港政府於同日下午6時宣佈在沙頭角實施宵禁，來往新界上水至沙頭角的九龍巴士20線（即後來的九龍巴士78K線）縮短服務至軍地。同年8月11日，香港政府宣佈香港邊境禁區全面封閉。
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根據統計，六七暴動造成最少52人死亡，當中包括11名警務人員，一名駐港英軍拆彈專家及一名消防員，几十名工人死难。包括200名警務人員在內的802人受傷，1936人被檢控。暴動期間共發現8,074個懷疑炸彈，以及1,167個真炸彈。