（二）文殊立誓
尔时，曼殊室利童子白佛言：“世尊，我于末法之时，誓以种种方便，令诸净信男子、女人，得闻七佛如来名号，乃至睡中，亦以佛名令其觉悟。
当时，曼殊室利童子对佛说：世尊，我在末法的时期，发誓用各种善巧方便，让那些具足清净信心的善男子、善女人，得以闻到七佛如来的名号，甚至梦里也以佛名使得他们觉悟。
也许这里的“以佛名令其觉悟”，是指他在梦中听到药师七佛如来的名号，或者加被他，在梦中能自己念这些佛的名号等等。这样，由于持了药师七佛的名号，闻信了名号等等，那么与药师七佛的悲愿相合，得加持后将有所觉悟。
世尊，若于此经受持读诵，或复为他演说开示，若自书、若教人书，恭敬尊重，以种种华香、涂香、末香、烧香、华鬘、璎珞、幡盖、伎乐而为供养，以五色缯彩而裹袠之，洒扫净处，置高座上。是时四大天王与其眷属，及与无量百千天众，皆诣其所供养守护。
接着文殊菩萨讲到，对于此经作十法行等等，将会得到天王、天众的守护。
当时文殊菩萨这样说：世尊，假使有人对这部经受持、读诵，他能很好地记在心里，持它的句和义，能阅读、背诵；或者还能给别人演讲，显示这部经的大义；或者自己恭敬地书写，教别人书写；而且对此经典有很纯净的恭敬之心，非常地尊重；然后用各种很好的花香、涂香、末香、烧香、鲜花串成的花鬘、璎珞、幡盖，奏起种种微妙的音乐来作供养；以五色彩缎作为囊袋，陈置《药师经》，将所在的住处洒扫干净，设立高座作为供坛，将此经安放其上。假使行者有这样的心和行为，那当然此处即是药师经法所在之处，那么当时就有四大天王连同他的眷属，以及无量百千天众，都会到他这个道场供养守护。
世尊，若此经宝流行之处及受持者，以彼七佛如来本愿功德，及闻名号威神之力，当知是处无复横死。亦复不为诸恶鬼神夺其精气，设已夺者，还得如故，身心安乐。”
世尊，如果是这部《药师七佛经》经宝流行的地方，以及有恭敬受持这部经法的人，就能得到七佛如来本愿功德以及闻信名号威神之力的加被。要知道，就在这个法宝所在处、行者所在处的地方，不再有死于非命的横死的现象。而且在这当中，以佛本愿功德的威神力和闻名号威神力的加被，在这个地方，也不会被那些邪恶的鬼神夺掉精灵之气。假使已经夺掉了，也能恢复健康，像过去那样身心安乐。
（三）说供养法
1、成满所愿
佛告曼殊室利：“如是如是，如汝所说。曼殊室利，若有净信男子、女人，欲供养彼七如来者，应先敬造七佛形像，安在清净上妙之座，散华烧香，以诸幢幡庄严其处。七日七夜受八戒斋，食清净食，澡浴身体著新净衣，心无垢浊亦无恚害，于诸有情，常起利乐慈悲喜舍平等之心。鼓乐弦歌称赞功德，右绕佛像，念彼如来所有本愿，读诵此经，思惟其义，演说开示。随其所愿，求长寿得长寿，求富饶得富饶，求官位得官位，求男女得男女，一切皆遂。
佛告诉曼殊室利：的确像你所说，如果有《药师经》流行之处，或者受持的话，将会消除横死的灾难，得到身心安乐。
接着佛又说：曼殊室利，如果有具清净信心的男子或女人，他们心中对于现世也有很多的愿望，然而光凭自己的力量无法实现，譬如想长寿不得长寿，想富饶偏偏贫贱，求官位难以实现，求男女也不得顺遂等等。作为一个凡人，毕竟对现世当中的事情相当地耽著，也有这样的欲求，那么，药师如来以慈悲的愿力加被众生，能让他先实现自身的愿望。因而，具有信心的男子、女人，应当供养七佛如来，内外清洁，行持有关药师法门的法行，以这样的缘起，引得佛力入心，由此转变命运，能以强大的药师如来的本愿威神，促成自身如法的愿望得以顺利实现。
这里世尊这样教导：假使怀着这样的愿望，想求佛力加被，首先应当供养七佛如来。有这个心的话，先要恭敬地造立药师七佛的形像，安在清净、很好的座位上，这就是把药师七佛请到家中。之后非常地郑重，散花、烧香，以幢幡庄严处所。这就是外部的清净。接着就是身心的清净，这是内的清净。也就是行人自己要在七天七夜里受持八关斋戒，使得身心清净。吃清净的食物，要沐浴、清洁，穿新净的衣服。之后，还要在内层上心里远离烦恼的浊垢，比如没有贪欲、疑虑等等，也没有忿恚、害人的心，对于诸有情，常常起作利乐的慈悲喜舍的平等之心。
接下来，对于七佛如来等，以鼓乐弦歌称赞佛的功德，又以从右到左恭敬的方式旋绕佛像，心中忆念药师七佛的所有本愿。加上还要作有关本经的法行，也就是读诵这部经；思惟其中的义理；因为其中的意义很甚深，在自己心里贯通、明白以后，向他人演说、开示等等。
如果作这样的内外洁净、奉事七佛如来的法行，对于这样的经法，非常殷重地行持法行，就像这样，当然就与七佛如来的本愿相合。以这样一种自身修因的力量，加上诸佛智悲力的力量，两者和合，随着自己心里的所愿，求长寿就会得长寿，求富饶也会得富饶，求官位也能顺利实现，求男女也能非常满愿。总而言之，一切如法的所求，以七佛本愿的威神加被，都会很顺利地加以实现。就像一个人依靠了非常大的靠山，行者得到非常大的七佛如来神力加被以后，很多事情就变得顺利了。
2、消灾免难
若复有人，忽得恶梦见诸恶相，或怪鸟来集，或于其家百怪出现。此人若以众妙资具，恭敬供养彼诸佛者，恶梦恶相诸不吉祥，悉皆隐没不能为患。
世尊再来开示消除恶相的方法。
我们的人生当中，常常会出现一些不吉祥的现象，而心里也感觉很恐怖，这个时候该怎么办呢？这里讲到，比如说忽然做了恶梦，见了好多恶相，或者来了好多不吉祥的鸟聚集在家里，或者家里各种怪相出现。那么，当受到各种怪异现象困扰的时候，假使能够以上等的资具，恭敬供养药师七佛，以这个供养的心，就好像恭敬供养自己的父母、长辈那样，这些师长们有慈悲心，能解决的就会帮你解决。那么在消灾免难上，具有不可思议神力的药师七佛，的确就遍在我们的心中，遍在我们的场所里。如果能够发出一分心来，就是要用很多很妙的资具，来恭敬供养药师七佛如来，那么诸佛当下就能见知我们的心，有比父母深切无数倍的慈悲；这样的话，自然就会加被在我们的相续上，使得恶梦、恶相等所有不吉祥的现象全数隐没不现。也就是不会再做恶梦，各种的怪象都消失了，没有能作加害的祸患了。因此，要想保平安、得吉祥，应当发至诚的心，去恭敬地供养七佛如来。
或有水、火、刀、毒、悬崖、险道、恶象、师子、虎、狼、熊罴、蛇、蝎、蜈蚣如是等怖，若能至心忆念彼佛，恭敬供养，一切怖畏皆得解脱。
还有在人生当中，遇到各种内外的恐怖之时，如果修持药师法门，就都能解脱怖畏。
这里世尊详细地说明，比如遇到水灾、火灾、刀兵之灾、毒害之灾，或者走在悬崖、险道等中，遇到恶象、狮子、虎、狼、熊、人熊等的猛兽，或者毒蛇、恶蝎、蜈蚣等可怕的害虫，在遭遇这些怖畏的时候，如果能够至心忆念药师七佛，恭敬供养，就都能得到解脱。
“怖畏”的范围很广，比如遇到了洪水，自身淹没在水中，或者遇到火灾，大火已经燃起来了；或者遇到战争，被怨家追杀，遭到毒害；要么就是走在悬崖峭壁、各种会发生事故的险道上；要么遇到可怕的猛兽、毒虫等等。当遭遇这些怖畏的时候，一定要一心祈求佛力护佑。怎么来连通呢？就是至心地忆念药师七佛。这样一心念着佛，恭敬供养，那么这些怖畏都能够得到解脱。当然，药师七佛的护念会以各种方式，使得这些灾难不落到身上来。
若他国侵扰、盗贼反乱，忆念恭敬彼如来者，所有怨敌悉皆退散。
如果有外国侵略、盗贼叛乱，那么在遭遇这种战争、叛乱等的时候，一般情况会受到很多烧杀抢掠、丧失性命等等，乃至整个国家都保不住。这时要一心地忆念、恭敬药师七佛，以佛力的护佑，这些内外的灾患都能够得到消除，一切的怨敌自然地都退散而去，得到和平安宁。
3、毁戒离苦
复次，曼殊室利，若有净信男子、女人等，乃至尽形不事余天，唯当一心归佛法僧，受持禁戒。若五戒、十戒、菩萨二十四戒、苾刍二百五十戒、苾刍尼五百戒，于诸戒中或有毁犯，怖堕恶趣。若能专念彼佛名号恭敬供养者，必定不生三恶趣中。
再者，曼殊室利，如果对于佛的圣教有清净信心的男子、女人等，他应当尽此一生不事奉其余的天魔外道，而唯一地一心归依于佛法僧三宝，受持禁戒。这里就讲到，假使有信心，就要一心归依和受戒，从居士到比丘等，受五戒、十戒、菩萨二十四戒、比丘二百五十戒、比丘尼五百戒，如果在诸戒当中出现了毁犯，当然害怕要堕落恶道。这时如果能够专心地持念彼佛名号，而且恭敬地作供养的话，一定不会生三恶趣中。
4、无诸产难
或有女人，临当产时受于极苦，若能至心称名、礼赞、恭敬供养七佛如来，众苦皆除。所生之子，颜貌端正，见者欢喜，利根聪明，少病安乐，无有非人夺其精气。”
如果有女人，临到要生产的时候，受着极度的苦痛，这时如果能够至心称念药师七佛的名号，礼敬、赞叹、供养七佛如来，这些苦都能消除。生下的孩子相貌端正，凡是见到的人都心生欢喜，而且根性敏利，非常聪明。生下来以后也是健康快乐，没有夜叉、恶鬼等的非人夺他的精气，就是由于他得到七佛如来庇护的缘故。
所以，母亲们在生产的时候，如果能够念七佛的名号等，就有这样的利益。
（四）劝信趣入
尔时，世尊告阿难言：“如我称扬彼七如来名号功德，此是诸佛甚深境界，难可了知，汝勿生疑。”
当时，佛对阿难说：像我称扬药师七佛的名号以及相应的功德，这是诸佛的甚深境界，以分别心难以了解它真实的状况，你要相信，不要起疑虑。
那么，实际世尊和阿难之间的对答是为了未来的众生。凡是诸佛的甚深行境，只有佛和与佛同等的人才可能了解，就是十地菩萨也没法全分了解。对于诸佛甚深的境界，不可思议的神力、名号、功德等等，这些唯一要以信心来趣入，如果有信心，那当然就接到了诸佛的加持。这样的话，在这部经里关键要对于药师七佛生信心，无论是他们的智慧、悲愿等，对这一切的神力都要相信。你信了，按照这个方法操作，当然就得无边的利益；如果生疑，那就没法接通，就不得利益，因此关键要以信心来趣入。
阿难白言：“世尊，我于如来所说契经深义不生疑惑。所以者何？一切如来身语意业皆无虚妄。世尊，此日月轮可令堕落，妙高山王可使倾动，诸佛所言终无有异。
阿难尊者启白佛说：世尊，我对于佛所说的契理契机的妙经的甚深义理，不会有疑惑生起的。什么缘故呢？我深深地知道，一切如来的身业、语业和意业，都是由如来的法身智慧、大悲，应着众生的因缘发出来的不可思议的业，这上面连一点虚妄的分别也没有，所以，全部是诚谛、真实的。世尊，可以这样说，假使这个世界的日轮和月轮，都能让它从空中堕落到地上，连那最崇高的须弥山王，都可以以大风使得它动摇，而诸佛的言教终究不会有变异的。
也就是，佛所说的都是诚谛之语，完全是事实，没有一点欺惑人的地方。因此，诸佛所宣说的真理之教，特别就本部药师经法而言，哪怕所有的世间界都毁灭无余，它也不会毁灭；哪怕所有的东西都会动荡、变动，它也不会变动，因此是所谓的“金刚语”。
世尊，然有众生信根不具，闻说诸佛甚深境界，作是思惟：‘云何但念七佛名号，便获尔所功德胜利？’由此不信便生诽谤。彼于长夜失大利乐，堕诸恶趣。”
阿难尊者又说：世尊，但是还是有众生不具信根，当听到诸佛甚深境界的时候，就会狐疑，想：“怎么只念个七佛名号，就得这么大的功德胜利呢？”由此不生信心，反而发生诽谤。那么，以这样一种谤佛经教的大的罪业，他将会在漫漫的长夜中失掉大利乐，堕在恶趣当中。
佛告阿难：“彼诸有情，若得耳闻诸佛名号堕恶趣者，无有是处，唯除定业不可转者。阿难，此是诸佛甚深境界难可信解，汝能信受，当知皆是如来威力。
佛对阿难说：那些有情，当他们耳中听到了诸佛的名号，诸佛加被的力量就摄着他的心，还要堕恶趣的话，是无有是处的；唯除那些已经造成定业，而无法逆转的情况。
阿难，这是诸佛甚深难测的境界，它不是生死情识的量所能解了的，它并非常识能见能闻，或者分别心能思惟、揣摩得到的，所以，就一般情况是难以发生信解的。对于这样不可思议的行境，你却能信受，要知道都是如来威力加被你的结果。
阿难，一切声闻及独觉等皆不能知，唯除一生补处菩萨。阿难，人身难得，于三宝中信敬尊重亦难可得，得闻七佛如来名号复难于是。阿难，彼诸如来无量菩萨行、无量巧方便、无量广大愿，如是行愿、善巧方便，我若一劫、若过一劫，说不能尽。”
阿难，对于这样的诸佛智悲力的境界——完全就在法身中无丝毫的移动，却能应众生的机无碍地作救度，这样的事情，一切声闻、独觉，以及“等”字所摄的其他各种类型的菩萨，都是没法了解的，唯除一生补处菩萨。
阿难，人身非常难得到，如同暇满的教法里所说，像瞎眼的盲龟，在海中百年浮出来一次，遇到随风飘荡的轭木的孔隙那样。就像这样，好不容易得到人身，可是做人当中，对于三宝能发生信心、恭敬和尊重，也是相当难得的。这样的对于三宝起了信敬、尊重，能闻到药师七佛如来的名号，比这还要难。真正具有很大的资粮、善根，才能闻到七佛如来的名号，因此，我们闻到的时候，应当生庆幸之心，应当一心与佛的悲愿相合，以自己的心和佛相应。
阿难，这些诸佛，实际上他们在过去因地行过无量的菩萨行，成就无量的善巧方便，发过无量广大的弘愿。那么这样从因上所修集的无量的行愿、方便，乃至果上成就的不可思议的功德，像我这样的具有无碍慧辩的人，昼夜不停地说上一劫，甚至超过一劫，也没法说完它的内容。